Вирус, если он на другом разделе или винте, действовать на свежеустановленную ОС?
Может, если это вирус из семейства autorun'неров
Правда и распознать его наличие не сложно, включив отображение скрытых и системных файлов и проверить наличие autorun.inf в корне дисков.